Dit onderzoek, uitgevoerd in opdracht van Rijkswaterstaat als onderdeel van de PAGW, richt zich op het benutten van organische reststromen uit vegetatiebeheer om het ecologisch functioneren van het Markermeer te versterken. Het Markermeer kampt momenteel met een tekort aan nutriënten en kwalitatief goede organische stof, wat de productiviteit van het voedselweb beperkt. Daarom werkt de Programmatische Aanpak Grote Wateren aan maatregelen langs de Noord-Hollandse Markermeerkust met de ontwikkeling van voorlanden als helofytenmoeras en overstromingsgrasland.
Met de maatregelen wordt veel ruimte gerealiseerd voor de ontwikkeling van waterriet. Naar verwachting is het nagebootste natuurlijk waterpeilbeheer onvoldoende om het rietmoeras vitaal te laten ontwikkelen. Verwacht wordt dat aanvullend vegetatiebeheer nodig zal zijn in de vernatte delen. De reststromen die daarbij vrijkomen worden in de huidige beheerpraktijk afgevoerd en komt dus niet ten goede aan het ecosysteem van het Markermeer. In een natuurlijke situatie dienen deze organische restmaterialen als detritus voor het aquatisch ecosysteem. Door de reststroom uit beheer actief terug te brengen in het Markermeersysteem kan de zogenaamde bruine voedselketen (detritus) worden gestimuleerd en dienen als vliegwiel voor de productiviteit van het ecosysteem.